小麦缺磷型红苗叶片暗绿，带紫红色，无光泽，植株细小，分蘖少，次生根极少，茎基部呈紫色。前期生长停滞，出现缩苗。冬前返青期叶尖紫红色，抽穗成熟延迟。穗小粒少，籽粒不饱满，千粒重低。分蘖期缺磷幼苗在三叶期后，开始显出缺磷症状。
小麦缺磷一般植株长相瘦弱，叶片上现紫红色，叶鞘上呈条状紫红色，长势慢，分蘖弱且少。当土壤中不缺氮而严重缺磷时，叶色暗绿，植株不分蘖，根系生长不良。小麦返青后，叶片和叶鞘仍表现紫红色，多无春季分蘖，新生根生长慢而少，烂根现象不断扩展。拔节期缺磷，除苗期主要的缺磷症状更为明显外，下层叶片逐渐变成浅黄色，从叶尖和叶边渐渐枯萎。
植株内的幼穗分化发育不良，新生根少，尤其是根毛坏死，烂根现象严重起来。抽穗开花期缺磷，表现为植株矮小，随着穗部生长发育，叶片从下层开始，从叶尖和边缘渐次枯萎引起花粉不育与胚珠不孕，增加退化小花数，小穗数和粒数减少，籽实不饱满，千粒重明显下降。严重时，有些不能抽穗或出现假“早熟现象”和瘦秕的死穗。