棉花缺磷症在幼苗期及成长期的危害各不相同，幼苗缺磷时容易导致叶片营养不良，缺磷较严重时会造成成铃少，使产量降低。
棉花缺磷症症状
幼苗缺磷时，其株高比正常的棉株明显矮小，叶片较小，叶色暗绿（由于缺磷而提高了铁的吸收利用，间接地促进了叶绿素的合成，使叶片呈暗绿色，但缺乏光泽）。如果不是十分严重，在5～6片真叶后缓解表现症状（这与根系发育、根量增加，植株吸磷能力增强有关）。
缺磷较严重时，导致植株生长发育迟缓，且叶片较小，植株茎秆细、脆弱，较正常植株矮小，根系生长量降低，结铃和成熟都延迟，成铃少、产量低、品质差。
棉花缺磷症特别注意
棉花幼苗2～3片真叶前后对磷素表现敏感，对磷的吸收高峰在开花盛期。缺素症状易发生于出苗后10～25天和花铃期。
棉花缺磷症防治方法
提倡在棉花播种前结合耕地一次性施入足量的磷酸二铵，如在底肥中施用磷肥不足或者施用了低含量劣质复合肥的棉田，应在苗期或者蕾期及早补施（因其磷素移动性小，要深施）。在苗期出现症状的，可叶面喷施“六高牌精品二氢钾”500倍液（市场上的便宜产品多为硫酸镁冒充二氢钾，注意鉴别真伪）、选用磷酸二铵0.5%水溶液加“壮汉”500倍液等营养调节剂（结合防病治虫而“未雨绸缪”先喷施）。