棉花立枯病俗称烂根病、黑根病。由立枯丝核菌引起，主要是寄生生活，也可腐生。病菌以菌丝体或菌核在土壤中或病残体上越冬，在土壤中形成的菌核可存活数月至几年。棉花棉苗立枯病防治方法有以下几种：
（1）棉花棉苗立枯病防治应选用抗病品种。如晋棉16号（师棉5号）、晋棉21号等。进行大面积合理轮作。
（2）提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥及5406菌肥。精细整地，提高播种质量。
（3）播种前精选棉种，并用种子重量0.5%-0.8%的50%多菌灵可湿性粉剂或种子重种。
（4）提倡采用脱绒包衣棉种，可提早出苗3-4天，减少发病。
（5）适期早播，春棉花应在5cm深处土温稳定在14℃时播种，播深4-5cm。
（6）加强苗期管理，适当早间苗，适时早中耕，注意降低土壤湿度，提高地温，培育壮苗，雨后注意排水，防止湿气滞留。
（7）出苗后病害始发期，用80%退菌特或20%稻脚青可湿性粉剂1000倍液灌根，或用25%多菌灵可湿性粉剂500倍液喷棉苗2-3次。