水稻纹枯病病菌核数量是引起发病的主要原因。每667m2有6万粒以上菌核，遇适宜条件就可引发纹枯病流行。高温高湿是发病的另一主要因素。气温18-34℃都可发生，以22-28℃适。发病相对湿度70%-96%，90%以上适。菌丝生长温限10-38℃，菌核在12-40℃都能形成，菌核形成适温度28-32℃。相对湿度95%以上时，菌核就可萌发形成菌丝。6-10天后又可形成新的菌核。日光能抑制菌丝生长促进菌核的形成。
水稻纹枯病适宜在高温、高湿条件下发生和流行。生长前期雨日多、湿度大、气温偏低，病情扩展缓慢，中后期湿度大、气温高，病情迅速扩展，后期高温干燥抑制了病情。气温20℃以让，相对湿度大于90%，纹枯病开始发生，气温在28-32℃，遇连续降雨，病害发展迅速。气温降至20℃以下，田间相对湿度小于85%，发病迟缓或停止发病。长期深灌，偏施、迟施氮肥，水稻郁闭，徒长促进纹枯病发生和蔓延。