番茄红粉病应及时进行用药控制，可加强作物间的通风排水，使得作物能够恢复生长。
（1）合理密植，避免植株过密，及时整枝，打权，中后期适时摘去下部老叶，以增加通透性。
（2）生态防治。棚室要加强放风排湿，使相对湿度低于85%，可有效地控制红粉病的发生和蔓延。
（3）发病初期，在病果尚未长出粉红色霉层之前摘除病果，装入塑料袋内，携出棚外，集中烧毁或深埋。
（4）药剂防治，重点是在苗期下雨前后和发病初期摘去病叶后施药，每隔5-10天再行用药，连治3-4次。药剂可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍稀释液，或50%托布津可湿性粉剂500倍稀释液，或百菌灵与多菌灵，或百菌清与托布津各1:1:1000混合液。发病初期熏烟百菌清烟雾剂，或喷粉10%百菌清粉尘剂，每1000平方米1.5千克。