棉花叶烧病病原属于类，子囊腔是球形，颜色呈黑色，子囊孢子是双细胞，上部细胞较宽，顶端尖细。
病原形态特征：
棉花叶烧病病原学名Mycosphaerellagossypina（Cooke）Earle.称棉球腔菌，属界、子囊菌门、腔菌纲、座囊菌目、座囊菌科、球腔菌属。子囊腔球形黑色，子囊孢子双细胞，上部细胞较宽，顶端尖细，大小12～14×5～7（μm）。无性态为CercosporagossypinaCooke.称棉尾孢，属界、半知菌类（无性类）、丝孢纲、丝孢目、暗丛梗孢科、尾孢属。分生孢子梗褐色，具隔膜1～5个，大小70～450×4～7（μm），分生孢子鞭状，无色，具隔膜6～16个，大小50～200×3～5（μm）。