在我国，玉米锈病越冬和初次侵染来源问题尚未完全明确。在广西、云南、贵州等南方各省、自治区，由于冬季气温较高，夏孢子可以在当地越冬，并成为当地第二年的初侵染菌源，但在甘肃、陕西、河北、山东等北方省份，由于冬季寒冷，夏孢子和冬孢子能否越冬尚存在争议，且也未发现酢浆草与玉米锈病的初侵染存在联系。总之，在北方玉米锈病发生的初侵染菌源主要是南方玉米锈病菌的夏孢子随季风和气流传播而来的。普遍锈病在相对较低的气温（16~23℃）和经常降雨、相对湿度较高（）的条件下，易于发生和流行。在我国西南山区玉米锈病正是在这样的条件下普遍发生的。据国外报道，玉为普通锈病的夏孢子堆和冬孢子堆阶段也可发生于大刍草上。
实践证明，偏施氮肥有利于玉米锈病的发生。不同玉米品种和品系对玉米锈病存在明显的抗性差异，马齿型较抗病，甜质型玉米则抗病性较差，生育期短的早熟品种发病较重。