1、炭腐病
主要危害果实。染病果实出现大块紫黑色至黑褐色斑，圆形至不定形，严重时患部危及果实大部分，变软变皱，仔细观察斑面密生针头大小黑粒，皮下果肉亦变褐腐烂，失水后外观似黑炭，故名炭腐。本病在采后贮藏期可继续发生危害。
2、疫病
该病主要危害冬瓜果实。染病果实患病部呈水渍状病变，发病与健康部位交界处出现一圈白色霉层。剖开病果，可以看见患病部位皮下果肉亦呈褐色病变，严重时导致果实倒囊腐烂。
3、冬瓜白粉病
冬瓜白粉病主要为害叶片、叶柄和茎蔓，果实受害少。初发病时菌丝体生于叶的两面和叶柄上，先产生白色近圆形星状小粉斑，向四周扩展后形成边缘不明显的连片白粉，严重时布满整个叶面，秋季，白色霉斑因菌丝老熟，逐渐变成灰色，病叶黄枯，有的病部长出成堆的黄褐色小粒点，后变黑，即病菌闭囊壳。
4、冬瓜病毒病
冬瓜病毒病，又称花叶病。冬瓜病毒病主要为害架冬瓜，致冬瓜呈全株性系统花叶或瓜畸形，发病早的病株节间缩短或矮化，花期叶片出现褪绿黄斑，逐渐形成斑驳或大型环斑，致整个叶片凹凸不平，有些品种呈明脉或沿叶脉变色。病情严重的病株率高达50%，损失较大。
5、冬瓜黑斑病
冬瓜黑斑病，寄生于葫芦科叶片或果实上，果实染病初生水渍状小圆斑，褐色，后病斑逐渐扩展为深褐色至黑色病斑，未见叶片染病。
6、冬瓜壳二孢叶斑病
冬瓜壳二孢叶斑病主要为害叶片，病斑圆形或近圆形，深褐色，大达10毫米以上，斑上微具轮纹，生长后期病斑上生出黑色小粒点，即病菌分生饱子器。
7、冬瓜性角斑病
冬瓜性角斑病主要为害叶片、叶柄和果实，有时也侵染茎。苗期至成株期均可受害。真叶染病，初为鲜绿色水浸状斑，渐变淡褐色，病斑受叶脉限制呈多角形，黄褐色，湿度大时叶背溢有乳白色浑浊水珠状菌脓，病部质脆易穿孔，别于霜霉病。