百合茎溃疡病主要表现在接近土壤和幼芽下部的绿叶上，受害叶片上有凹陷斑，呈浅褐色斑点。受害茎上形成褐色溃疡病，待干燥时留下褐色。发生严重时，导致根颈部或根腐烂。
发生规律：
该菌以菌丝在病残组织上或以小菌核在土壤中长期存活，病菌可直接或间接侵入百合的茎基部。在苗期连续阴天，气温低于20℃时，高湿环境下、土壤粘重发病重。
防治方法：
（1）加强栽培管理，合理施肥灌水，增强植株抵抗力。合理密植，调节通风透光，雨季注意排水措施，保持适当温湿度。及时清理卫生，将病残体烧毁或深埋。
（2）冬季进行土壤。
（3）化学防治发病初期喷淋20%甲基立枯磷（利克菌）乳油1200倍液或40%五氯硝基苯粉剂500倍液，严重时可用40%五氯硝基苯，667平方米用药4-5kg，均匀撒在地表后耙入土中进行药剂处理土壤有效。