水稻穗颈瘟是水稻上常发性、气流性主要病害，直播稻扬花灌浆期，由于气候条件适宜，水稻很容易发生穗颈瘟。染病后，随着病菌的繁殖与危害，穗颈节坏死，输送到穗子的养分通道被阻断，从而形成白穗或瘪粒的稻穗。一旦穗颈染上稻瘟病，会造成不同程度减产。
危害症状
水稻穗颈瘟是稻瘟病的一种形式，发生在水稻穗颈部位。穗颈瘟初期形成褐色小点，扩展后使穗颈部变褐，也造成枯白穗。发病晚的造成秕谷。枝梗或穗轴受害造成小穗不实。
传播规律
病菌以分生孢子和菌丝体在稻草和稻谷上越冬，翌年产生分生孢子借风雨传播到稻株上，萌发侵入寄主向邻近细胞扩展发病，形成中心病株。病部形成的分生孢子，借风雨传播进行再侵染。播种带菌种子可引起苗瘟。适温高湿，有雨、雾、露存在条件下有利于发病，菌丝生长温限8~37℃，适温度26~28℃。孢子形成温限10~35℃，适温度25~28℃，相对湿度90%以上。孢子萌发需有水存在并持续6~8h.适宜温度才能形成附着孢并产生侵入丝，穿透稻株表皮，在细胞间蔓延摄取养分。阴雨连绵、日照不足、时晴时雨、早晚有云雾以及结露条件下，病情扩展迅速。
发病条件
（1）品种抗性。不同品种间的抗性有明显差异，当前生产上所用抗病品种多属垂直抗性品种，其抗性因生理小种组成只能保持一定时期抗性，一旦劣势小种变为优势小种，某些品种就会丧失抗病性，使病害发生。一般籼型品种的抗性优于粳型品种。
（2）菌源数量。如带菌种子多，又未进行浸种，尤其是病稻草、病秕谷未经销毁或处理不彻底等，越冬菌源多，发病就重。
（3）气象条件。如分蘖期阴雨连绵，雨日和雨次多，形成高湿、低温、寡照（日照时数少）的环境，会降低水稻抗病性，从而有利于病害发生。抽穗期前后为连雨天气，降雨日多，降雨次数多，形成高湿、低温、寡照条件，不利于水稻生育；但对病菌孢子的产生、孢子萌发侵入有利，其中，高湿有利病菌孢子萌发与侵入；而低温寡照条件使穗颈瘟、节瘟、谷粒瘟发生较重。
（4）稻田管理。如施用氮肥过多、过晚，经常冷水灌、深水灌等，会降低水稻抗病力，均可加重病情。穗期以始穗时抗病性弱。偏施、过施氮肥有利于发病。放水早或长期深灌根系发育差，抗病力弱发病重。
防治方法
1.水稻穗颈瘟的症状：发生在穗颈、穗轴及枝梗上，病部成段变褐坏死，穗颈、穗轴易折断变成白穗，老百姓称为“掐脖瘟”，轻则减产10-20%，重则绝收。
2.防治所用的药剂和时期：水稻穗颈瘟防治时的关键时期是水稻15%抽穗期和齐穗期。（齐穗期在我区一般是8月5日-10日左右）
3.防治水稻穗颈瘟防治药剂是：25%的使百克（咪鲜胺）、75%三环唑、40%富士一号、40%克瘟散、40%稻瘟灵。
4.打药的时间：即晴天的上午露水落下之后，并保证打药10小时内不下雨，如遇下雨应补喷药剂。药剂兑水量要充足，药时喷雾器的喷嘴要朝上，从下向上喷药，以利于提高喷药效果。防治穗颈瘟至少要防治两次，并且要做到药剂轮换使用。