染病植株的地上部呈现生长停滞，叶片失绿、黄萎、脱落，严重时整株死亡。病株的根部（地下蔓和根）的表面有菌索、菌膜。根据受害根部的菌索、菌膜的颜色和形态特征可区分为红根腐病、褐根腐病和紫根腐病。
胡椒根腐病的类型：
红根腐病 受传染的根部，表面粘有一层泥沙，用水洗湿根部和洗去泥沙后，可以看到根表有层红色至枣红色菌膜。
褐根腐病 病根表面粘着泥沙，凸凹不平、不易洗脱，其间有铁锈色绒状菌丝体和黑褐色薄而脆的菌膜，削去皮层，在木质部有蜂窝状褐纹。
紫根腐病 在主蔓基部，常见有紫色松软如海绵状的菌膜（子实体）紧贴着，病根表面不粘泥沙，但有密集的深紫色菌索覆盖着。