苦瓜病毒病早发病的植株叶片变小，皱缩，节间缩短，全株明显矮化，不结瓜或结瓜少。中后期迟发病的叶片皱缩，叶色浓淡不均呈花叶斑驳状，幼嫩梢蔓畸形，生长受阻，瓜小或尾尖，畸形扭曲。
苦瓜病毒病的病原及发病特点：
病原为病毒。包括黄瓜花叶病毒（CMV）和西瓜花叶病毒（WMV），单独或复合侵染引起。两种病毒均在田间活体寄主上存活，借助汁液摩擦和蚜虫传染。土壤不能传染，种子有可能传毒。任何有利于蚜虫繁殖活动的天气及植地环境条件，对本病的发生蔓延有利。品种间抗病性差异尚缺调查。目前仅知湘苦瓜（湖南）对本病及枯萎病表现高抗，中抗霜霉病和白粉病，其余一些一般表现抗逆或抗病性的品种，如兰山大白苦瓜（湖南）、云南大白苦瓜、扬子洲大纹苦瓜（江西）、滑身苦瓜与穗新2号、翠绿1号（广东）、槟城长身苦瓜（外引）等是否也抗病毒病，皆有待各地进一步观察鉴定。湘苦瓜值得各地引种，并可以作为抗病育种亲本加以利用。