甜瓜蔓枯病主要为害主蔓和侧蔓，有时也为害叶柄、叶片。叶片受害初期在叶缘出现黄褐色“V”字型病斑，具不明显轮纹，后整个叶片枯死。叶柄受害初期出现黄褐色椭圆型至条型病斑，后病部逐渐缢缩，病部以上枝叶枯死。
（1）茎蔓：病蔓开始在近节部呈淡黄色。油浸状斑，稍凹陷，病斑椭圆形至梭形，病部龟裂，并分泌黄褐色胶状物，干燥后呈红褐色或黑色块状。生产后期病部逐渐干枯，凹陷，呈灰白色，表面散生黑色小点，即分生孢子器及子囊壳。
（2）叶片：叶片上病斑黑褐色，圆形或不规则形，其上有不明显的同心纶纹，叶缘病斑上有小黑点，病叶干枯呈星状破裂。
（3）果实：果实染病，病斑圆形，初亦呈油渍状，浅褐色略下陷，后变为苍白色，斑上生有很多小黑点，同时出现不规则圆形龟裂斑，湿度大时，病斑不断扩大并腐烂。