病菌以菌丝潜伏在种子内或随病残体在土壤中越冬。翌年侵染幼苗的根，从根尖或伤口侵入，也能直接侵染健根，进入导管，向上蔓延到植株各部。连作地、土温高、湿度大的瘠薄砂壤土易发病。品种间抗病性有差异。
防治方法
（1）选用抗病品种如宁津八筒白、巨野大歪嘴、金乡芝麻、平邑白芝麻、荣城黑芝麻、即墨杈芝麻等。（2）进行3～5年轮作。收获后及时病残体。（3）选用无病种子或种子用0.5%的96%硫酸铜浸种30分钟。（4）注意防治地下害虫。（5）采用地膜覆盖栽培可减轻发病。（6）国外报道用百菌清进行土壤处理防效较好。