苗期成株期均可发病，主要为害茎，叶。苗期发病，子叶变黄，不久干枯，幼茎、叶片、叶柄及生长点萎蔫或根茎基部变褐，缢缩或猝倒。成株发病茎基部纵裂或部分叶片中午萎蔫，早晚恢复，叶色变淡，后全部萎蔫，植株枯死。
（1）选用抗枯萎病品种，如绿丰节瓜。与非瓜类作物实行3年以上轮作。
（2）种子用50％多菌灵可湿性粉剂或60％多菌灵盐酸盐（防霉宝）可溶性粉剂500倍液浸种1小时，洗净后催芽播种，或用种子重量0.3％的50％福美双可湿性粉剂或每2kg种子用绿亨1号1-1.5g拌种。
（3）无病土营养钵育苗，定植时不伤根，高畦、地膜栽培，地温低时少浇水，多施腐熟有机肥，增加根际微生物拮抗作用。
（4）苗床土，每m2苗床土用50％多苗灵可湿性粉剂10g，拌匀播种。定植时用50％多菌灵可湿性粉剂667平米3.5kg，掺细土施用。
（5）发病初期喷洒或浇灌50％氯溴异氰尿酸（消菌灵）可溶性粉剂1000倍液、30％苯噻氰（倍生）乳油1300加倍液、30％恶霉灵（土菌消）水剂800倍液、50％琥胶肥酸铜（DT）可湿性粉剂350倍液、20％甲基立枯磷乳油900倍液、3％广枯灵水剂800倍液，每株灌对好的药液0.5L，隔10天左右再灌1次，连续防治2次。