大豆叶斑病主要为害叶片，叶上初散生灰白色不规则形病斑，扩展后大小为2-5mm，中间浅褐色，四周深褐色，病、健部界限明显，后病斑干枯，上生黑色小粒点，即病原菌子囊壳。
病原MycosphaerellasojaeHori称大豆球腔菌，属子囊菌亚门。子囊壳黑褐色，球形至近球形，近表生，壳壁膜质，有孔口，大小70-130μm，子囊束长在子囊壳里，圆筒形至棍棒状，大小35-73×8-13（μm），无侧丝，子囊内含有子囊孢子8个，排成双行，子囊孢子无色，梭形至纺锤形，具隔膜1个，隔膜处略缢缩，大小13-23×4-9（μm）。国外报道M.cruenta（Sacc.）Lath和M.phaseo10rumSiemszko.也是该病病原。