黄瓜沤根是由低温或积水等原因引起的生理性病害，一般在移苗或定植初期发生，导致植株根系生长不良，不长新根，从而引起秧苗死亡，给生产带来较大损失。
黄瓜沤根病主要是地温低于12℃，且持续时间较长，再加上浇水过量或遇连阴雨天气，苗床温度和地温过低，瓜苗出现萎蔫，萎蔫持续时间一长，就会发生沤根。沤根后地上部子叶或真叶呈黄绿色或乳黄色，叶缘开始枯焦，严重的整叶皱缩枯焦，生长极为缓慢。在子叶期出现沤根，子叶即枯焦；在某片真叶期发生沤根，这片真叶就会枯焦，因此从地上部瓜苗表现可以判断发生沤根的时间及原因。长期处于5～6℃低温，尤其是夜间的低温，致生长点停止生长，老叶边缘逐渐变褐，致瓜苗干枯而死。