防治二化螟是在稍早的时间，即水稻的分蘖期喷洒药剂，特别是防治枯心苗和枯鞘。所用药剂是一致的。除了化学方法以外，也要注意采用农业、物理和生物的防治技术。由于这种虫子以4龄以上幼虫在稻桩、稻草中或其他寄主的茎秆内、杂草丛、土缝等处越冬，所以秋天深翻地，春天深水泡田，杂草，稻草，消灭越冬虫源也是重要的防治措施。
在化蛹盛期和防治适期加深水层，孕穗后至蜡熟要确保田间有水，迟中稻和晚稻更要注意田间保水，可减少二化螟转株为害。利用成虫具有趋茂密、高大、嫩绿稻株产卵的习性，避免偏施氮肥，配合施用磷、钾肥，适时晒田防止水稻长势过旺可以减少二化螟产卵数量。利用成虫趋光性，在二化螟蛾进入盛发阶段，采用黑光灯诱杀成虫，在成虫高峰期，释放赤眼蜂消灭虫卵等措施也都能起到良好的防虫作用。