柑橘黄龙病的产生是类菌原体，如果挖除病树做到不留残桩，但还会余留在土壤当中，是不能从根源上根除病害的，这是治标不治本的办法。
柑橘黄龙病的病菌寄生于柑桔韧皮部筛管细胞内和薄壁细胞内。主要的是果农缺乏科学种植知识，缺乏科学管理，盲目施用化肥，特别是在果树种植初期，果农为让果树加速生长，大量使用复合肥和尿素，或者用一些杂牌复合肥，因为有些复合肥微量元素含量较低，会使果树无法吸收应有的养分，一些垃圾肥本身带有很多有害菌体，殖入土地后有害菌在土壤中不断繁殖，阻止果树吸收应有养分，果农见果树有病害又盲目打药，而且对病性是否起到作用，没有科学的判断，这样会导致越治越严重。只有从源头上进行根治才是解决黄龙病的办法，治根要治本，应从树的须根开始治理，用生物治理和物理治理，让须根生长发达才是根本治理方法。