棉花花叶病毒病的农业防治，刚开始的时候选用抗病品种，主力合理密植，适当增加间距，注意施肥量。
棉花花叶病毒病农业防治：
（1）播种前或收获后，田间及四周杂草、菟丝子和农作物病残体，集中烧毁或沤肥；深翻地灭茬，促使病残体分解，减少病原和虫原。
（2）和非本科作物轮作，水旱轮作。
（3）选用排灌方便的田块，开好排水沟，降低地下水位，达到雨停无积水；大雨过后及时清理沟系，防止湿气滞留，降低田间湿度，这是防病的重要措施。
（4）土壤病菌多或地下害虫严重的田块，在播种或移栽前要撒施或沟施杀虫的药土。
（5）选用抗病品种，选用无病、包衣的种子，如未包衣则种子须用拌种剂或浸种剂。
（6）育苗移栽，播种后用药土覆盖种子，移栽前喷施一次除虫剂，这是防病的关键。
（7）大田直播的，要适时早播，早间苗、早培土、早施肥，及时中耕培土，培育壮苗；幼苗封行前喷施一次除虫的混配药剂。
（8）施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟的有机肥，不用带菌肥料，施用的有机肥不得含有植物病残体。采用测土配方施肥技术，适当增施磷钾肥，加强田间管理，培育壮苗，并在台风、大雨过后，及时追肥，增强植株抗病力，有利于减轻病害。
（9）及时防治害虫，减少植株伤口，减少病菌传播途径；发病时及时病叶、病株，并带出田外烧毁，病穴施药或生石灰。
（10）合理密植，及时整枝，及时摘除茎部处2～3片叶子，及时剪空枝、打老叶、拔除病株，集中烧毁，病穴施药，增加田间通风透光度。
（11）高温干旱时应科学灌水，以提高田间湿度，减轻蚜虫、灰飞虱危害与传毒。严禁连续灌水和大水漫灌。