大豆加拿大一枝黄花属多年生草本植物，可用物理防治、化学防除、生物防治多种途径去除。
大豆加拿大一枝黄花物理防治：目前对于加拿大一枝黄花连片生长区，针对其根系分布较浅的特点，一般采用连根拔除之后焚烧的方式进行防治。此法虽然较彻底，但费时费力，成本高，效率低。也可以在开花期剪去花枝，减少种子形成量。此法相对简便但不彻底，无法地下繁殖器官。根据观察发现加拿大一枝黄花主要危害的是荒地和免耕地，在有人工栽培措施的地方很少发现。根据加拿大一枝黄花种子小、发芽势差、顶土能力弱的等点，耕翻飘撒有加拿大一枝黄花种子的地块，发现如果其种子被翻入土下5厘米以下就无法发芽出土。因此可在冬季对一枝黄花主要落种区实施耕翻，覆盖种子，以减少春季出苗量。
大豆加拿大一枝黄花化学防除：化学防除应是控制加拿大一枝黄花经济有效的手段。在其苗期或成株期，可用草甘膦等灭生性除草剂及其复配剂防除。克无踪是触杀型除草剂快但不能杀死地下部分。因此采用草甘膦，利用其内吸传导特性可杀死地下部分，防除效果较好。
目前，针对加拿大一枝黄花的除草剂配方筛选鉴定尚未见报道，这方面应着手进行研究和开发。
大豆加拿大一枝黄花生物防治：2004年11—12月，我们在南京和苏州地区调查表明，某种蛾类幼虫取食加拿大一枝黄花的叶子，并在植株的茎秆中发现了钻人的幼虫以及另一种昆虫的卵和成虫（似寄生实蝇）。上海地区也有相关报道。可以考虑利用这些天敌昆虫对加拿大一枝黄花的扩散进行有效遏制。但这些昆虫的投放还需考虑是否对加拿大一枝黄花具有专一性，以确保大量投放后对作物及当地生态环境的性。因此对这些天敌进行鉴定，明确其生长习性等生物学特性，并对其是否投放、如何投放、投放范围等综合评价也有待进一步研究。