水稻眼子菜的防治每亩每次用药量，可任意选用以下一种，但应注意在海拔1500米以下的河谷热区，用药量应酌情减少，取下限数（即量）。
①50%的威罗生（排草净）乳油100-150毫升；
②50%的扑草净可湿性粉剂70-90克或25%的敌草隆可湿性粉剂70-90克；
③78.4%的禾田净乳油200-250毫升；
④50%的扑草净可湿性粉剂50克，加50%的杀草丹乳油150克；
⑤50%的扑草净可湿性粉剂50克，加26%的敌草隆可湿性粉剂50克。以上任选一种除草剂，拌细潮土30-40千克均匀撒施即可。
此外，在水稻收割后还可以用以下方法，减少第二年牙齿草对水稻的危害。
（1）在水稻收割后，排干田水，立即亩用25%的敌草隆（或50%的扑草净）可湿性粉剂200克兑水50千克均匀喷射牙齿草，喷药后田内保持无水4-5天，然后按正常情况犁田种小麦、油菜等小春作物。若不翻犁而种稻桩蚕豆、绿肥等则除草效果稍差。但施药至种小春作物的间隔时间需在一个月以上。
（2）冬水田在收割水稻后，亩用25%的敌草隆或50%的扑草净可湿性粉剂200克，拌细潮土30千克，以浅水层毒土法施药，或排干田水后兑水50千克均匀喷射眼子菜，隔7-10天再蓄水，防除效果较好。