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黄瓜镰刀菌根腐病的病菌主要侵染植株根部，发病初期，病株根部主根或须根变黄，借雨水或灌溉水传播蔓延，进行再侵染。
高温、高湿利其发病，连作地、低洼地、载土地或下水头发病重。地上部无明显可见症状，后病部逐渐扩展，地上部中午时叶片下垂，早晚恢复。几天后，根部呈黄褐色湿腐，地上部呈青枯状萎蔫、死亡。
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