牡丹根朽病主要发生在牡丹根系，由小蜜环菌引起，使根部变黑腐烂。
牡丹根朽病症状：
主要为害老弱植株的根颈部，沿主干和主根上下蔓延，病部水渍状，紫褐色，皮层与木质部之间，充满白色或浅黄 色扇形菌丝层，边缘整齐清晰，病组织有蘑菇气味，黑暗中可发绿色光，皮层分离成多层薄片溃烂，木质部腐朽。
牡丹根朽病发病规律：
以菌丝体及菌索在朽根上腐生，菌素起传染作用，重茬地发病重。
牡丹根朽病防治方法：
①实行轮作，避免重茬，加强地下害虫的防治。
②种苗处理，剪去病残根，放入3000倍绿亨一号液中浸泡10-15分钟，晾干后栽植。
③生长期发现病株可用5%速克灵、特立克每株2克、福美双每株3-5克、绿亨一号3000倍液每株500-1000毫升，均有良好的防治效果。