芫荽株腐病又称死苗或死秧。常见于苗期和采种株。苗期染病主要为害幼苗嫩茎或根茎部，刚出土幼苗即见发病，初茎部或茎基部呈浅褐色水渍状，后发生株腐或猝倒，严重的一片片枯死。采种株染病，引致全株枯死，在枯死病株一侧可见粉红色霉层，即病原菌分生孢子梗和分生孢子。
病原形态特征
FusariumoxysporumSehlecht称尖镰孢，属半知菌亚门。病部表面产生粉红色霉层，即病菌分生孢子梗和分生孢子。分生孢子梗无色，大小6～40×2.5～4微米；分生孢子无色，弯月形，具0～3个横隔膜，大小6.25～42.5×3.25～6.25微米。此外还分离到Pythiumaphanidermatum（Eds.）Fitzp.称瓜果腐霉，属鞭毛菌亚门。分生孢子座常在下端形成；分生孢子梗无色，由菌丝分枝产生；大型分生孢子无色，长镰刀形，两端稍弯曲，具3个隔膜；小型分生孢子单胞，无色，长椭圆形；分生孢子可从枯死株和种子上长出。
传播途径和发病条件
病菌主要以菌丝体、分生孢子及厚垣孢子等随植株病残体在土壤中或种子上越夏或越冬，未腐熟的粪肥也可带菌，病菌可随雨水及灌溉水传播，从根部伤口或根尖直接侵入，侵入后经薄壁细胞到达维管束，在维管束中，病菌产生镰刀菌素等有毒物质，堵塞导管，致叶片萎蔫枯死。高温多湿利于发病；土温25～30℃，土壤潮湿、肥料未腐熟、地下害虫、线虫多易发病，土温低于25℃、高于39℃很少发病。
防治方法
（1）应与葱蒜类、禾本科作物实行3～5年轮作、避免连作。
（2）施用日本酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥，采用配方施肥技术，提高寄主抗病力。
（3）采用高畦或起垅栽培，雨后及时排水，严禁大水漫灌。
（4）药剂防治：用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或40%多菌灵胶悬剂400倍液或50%托布津可湿性粉剂400倍液灌根，每株药液0.3-0.5千克，每10天灌液一次，连续2-3次。